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Teacher, External teacher |
Title, Public comment, URL |
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w35 | Monday 2022-08-29 w35 | ||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Compulsory, Introduction | Dag Ahrén, Eran Elhaik | Bioinformatics: meet your coordinator Group photo | |||||||||||||||||||||||||
10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Dag Ahrén | Bioinformatics - an overview | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Anna Runemark, Arthur Boffelli Castro, Dag Ahrén | Computer set up and introduction | |||||||||||||||||||||||||
Tuesday 2022-08-30 | |||||||||||||||||||||||||||||
08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Structural bioinformatics | |||||||||||||||||||||||||
10:15 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Damandeep Kaur | Structural bioinformatics | |||||||||||||||||||||||||
Wednesday 2022-08-31 | |||||||||||||||||||||||||||||
08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part I) | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 15:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Damandeep Kaur | Practical Sequence analysis (I) | |||||||||||||||||||||||||
Thursday 2022-09-01 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Eran Elhaik | Introduction to population genetics | |||||||||||||||||||||||||
10:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Eran Elhaik, Mara Vizitiu | Portfoloio, Project structure and Reproducibility | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 14:00 | BINP11 | Compulsory, Information | Navigating your way through studies in Sweden, Jep. General information, Tina och Lotta. Compulsory for all new master's students. Location: A213 Hörsal | ||||||||||||||||||||||||||
Friday 2022-09-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Markus Ringnér | Hidden Markov models (HMM) | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Mattis Knulst, Mara Vizitiu | Hidden Markov models (HMM) | |||||||||||||||||||||||||
w36 | Monday 2022-09-05 w36 | ||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Markus Ringnér | Artificial Neural Networks (ANN) | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Mattis Knulst, Mara Vizitiu | Artificial Neural Networks (ANN) | |||||||||||||||||||||||||
Tuesday 2022-09-06 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Dag Ahrén | Nucleic acid and protein sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
10:00 - 16:00 | BINP11 | Lecture, Laboratory session | Arthur Boffelli Castro, Dag Ahrén | Nucleic acid and protein sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
Wednesday 2022-09-07 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Dag Ahrén | Biological databases | |||||||||||||||||||||||||
10:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Arthur Boffelli Castro, Dag Ahrén | Biological databases | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 15:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part II) | |||||||||||||||||||||||||
Thursday 2022-09-08 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part III) | |||||||||||||||||||||||||
10:15 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Claes von Wachenfeldt, Damandeep Kaur | Practical sequence analysis (III). | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 17:00 | BINP11 | Excursion | All: Excursion w bus to interesting places around Lund, bring fika and good shoes (some walking). Note: We only go if the weather is ok! | ||||||||||||||||||||||||||
Friday 2022-09-09 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Eran Elhaik | Bacterial genome analysis | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Eran Elhaik, Mara Vizitiu | Genome analysis | |||||||||||||||||||||||||
w37 | Monday 2022-09-12 w37 | ||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Eran Elhaik | Population genetics | |||||||||||||||||||||||||
10:15 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Eran Elhaik, Sara Behnamian | Population genetics | |||||||||||||||||||||||||
Tuesday 2022-09-13 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Mikael Pontarp | Phylogenetic analysis (I and II) | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 14:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Mikael Pontarp | Phylogenetic analysis (III) | |||||||||||||||||||||||||
14:00 - 16:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Mikael Pontarp | Phylogenetic analysis (III) | |||||||||||||||||||||||||
Wednesday 2022-09-14 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Phylogenetic analysis using MEGA | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Project: Phylogenetics | |||||||||||||||||||||||||
Thursday 2022-09-15 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Project: Phylogenetics | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 15:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Lecture on Scientific Writing, Caroline Isaksson. Location: A213 Hörsal | ||||||||||||||||||||||||||
Friday 2022-09-16 | |||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Project: Phylogenetics, presentations | |||||||||||||||||||||||||
w38 | Monday 2022-09-19 w38 | ||||||||||||||||||||||||||||
09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Helena Persson | Next-generation sequencing (NGS) application | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Helena Persson, Virá Varga | Next-generation sequencing (NGS) application | |||||||||||||||||||||||||
Tuesday 2022-09-20 | |||||||||||||||||||||||||||||
10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Dimitrios Floudas | Eukaryotic genome analysis (I) | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Dimitrios Floudas | Gene annotation methods | |||||||||||||||||||||||||
Wednesday 2022-09-21 | |||||||||||||||||||||||||||||
10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Dimitrios Floudas | Eukaryotic genome analysis (II) | |||||||||||||||||||||||||
13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Dimitrios Floudas | Gene annotation methods | |||||||||||||||||||||||||