|
Tid 08:00 - 18:00
| |||||||||||||||||||||||||||||
Tid |
Aktivitet |
Lokal, Platskommentar |
Lärare, Externa lärare |
Titel, Publik kommentar, URL |
|||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| v 4 | Mån 20 Jan. v 4 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 11:15 | Introduktion, Obligatoriskt | Heden (G110) | Helena Westerdahl, Staffan Bensch | Introduction and presentation | |||||||||||||||||||||||||
| 11:30 - 12:00 | Exkursion, Obligatoriskt | Heden (G110) | Gather equipment and prepare for excursion | ||||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 14:00 | Föreläsning | Heden (G110) | Staffan Bensch | DNA diagnostics and BarCoding | |||||||||||||||||||||||||
| Tis 21 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:30 - 15:00 | Exkursion, Obligatoriskt | Helena Westerdahl, Mikael Sörensson, Staffan Bensch | Excursion | ||||||||||||||||||||||||||
| 15:00 - 16:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | DNA extraction | |||||||||||||||||||||||||
| Ons 22 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:00 - 12:30 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | DNA extraction continued | |||||||||||||||||||||||||
| 13:30 - 14:30 | Föreläsning | Heden (G110) | Helena Westerdahl | Basic PCR and Sequencing | |||||||||||||||||||||||||
| 14:30 - 16:30 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | DNA extaction continued / set up PCR | |||||||||||||||||||||||||
| Tors 23 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | Obligatoriskt, Seminarium | Ris - Hjortronet (T104), Ris - Kråkbäret (T107), Ris - Lingonet (T105), Ris - Ripbäret (T106) | Aivars Cirulis, Hanna Sigeman | Chapter 3 & 4 (Molecular Biology and tools for ecologists) | |||||||||||||||||||||||||
| 10:30 - 13:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | DNA extaction continued / set up PCR | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 14:30 | Information | Information om utbytesstudier (på svenska). Tina Ledje. Lokal: Receptorn (D205) i biologihuset. | |||||||||||||||||||||||||||
| Fre 24 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:00 - 12:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | PCR products on minigels, precipitate PCR | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 14:15 | Föreläsning | Heden (G110) | Staffan Bensch | Sequence analyses & phylogenetic trees 1 | |||||||||||||||||||||||||
| 14:30 - 16:30 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | PCR for sequencing reaction | |||||||||||||||||||||||||
| v 5 | Mån 27 Jan. v 5 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 11:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | Staffan Bensch | Internet-based sequence analyses | |||||||||||||||||||||||||
| 11:15 - 12:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | PCR continued, precipitate sequencing rxn | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:30 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | David Gomez Blanco, Samantha Mellinger | Continued, sequence rxn to ABI robot | |||||||||||||||||||||||||
| Tis 28 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 11:15 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | Anne Duplouy, Staffan Bensch | Alignment Exercise | |||||||||||||||||||||||||
| 12:30 - 13:30 | Föreläsning | Heden (G110) | Max Lundberg | Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
| 13:30 - 16:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | Helena Westerdahl, Max Lundberg | BLAST & ORF | |||||||||||||||||||||||||
| Ons 29 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | Föreläsning | Heden (G110) | Staffan Bensch | Phylogenetic trees 2 | |||||||||||||||||||||||||
| 10:30 - 12:00 | Obligatoriskt, Seminarium | Ris - Hjortronet (T104), Ris - Kråkbäret (T107), Ris - Lingonet (T105), Ris - Ripbäret (T106) | Emily O'Connor, Hanna Sigeman | Chapter 8 (Neutral and adaptive molecular variation) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 14:30 | Föreläsning | Heden (G110) | Staffan Bensch | Phylogenetic trees 3 | |||||||||||||||||||||||||
| Tors 30 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110), Krypt - Masklaven (T105a), Krypt - Renlaven (T108), Ris - Ripbäret (T106) | Staffan Bensch | Editing & aligning obtained sequences | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | Information | Information about Master´s degree projects. Compulsary for Master´s programme students in Biology. Location: heden. Ecology building | |||||||||||||||||||||||||||
| Fre 31 Jan. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:30 - 12:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | Staffan Bensch | Neighbor joining and other tree analyses of sequences | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | Laboration, Obligatoriskt | Ris - Hjortronet (T104), Ris - Kråkbäret (T107), Ris - Lingonet (T105), Ris - Ripbäret (T106) | Staffan Bensch | Phylogenetic analyses of obtained sequences | |||||||||||||||||||||||||
| v 6 | Mån 3 Feb. v 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | Föreläsning | Heden (G110) | Helena Westerdahl | Molecular methods | |||||||||||||||||||||||||
| 10:30 - 12:00 | Föreläsning | Heden (G110) | Niklas Wahlberg | Molecular clocks and dating | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | Självstudier | Ris - Hjortronet (T104), Ris - Kråkbäret (T107), Ris - Lingonet (T105), Ris - Ripbäret (T106) | Prepare for presentation | ||||||||||||||||||||||||||
| Tis 4 Feb. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | Självstudier | Ris - Hjortronet (T104), Ris - Kråkbäret (T107), Ris - Lingonet (T105), Ris - Ripbäret (T106) | Prepare for presentation | ||||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | Obligatoriskt, Seminarium | Heden (G110) | Helena Westerdahl, Mikael Sörensson, Staffan Bensch | Presentation projects BarCoding | |||||||||||||||||||||||||
| Ons 5 Feb. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:30 | Föreläsning | Heden (G110) | Bengt Hansson | Genes in populations I - diversity | |||||||||||||||||||||||||
| 10:30 - 12:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | Bengt Hansson | Population structure exercise I - allele data | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | Laboration, Obligatoriskt | Heden (G110) | Bengt Hansson | Population structure exercise I - allele data | |||||||||||||||||||||||||
| Tors 6 Feb. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:30 - 12:00 | Obligatoriskt, Seminarium | Ris - Hjortronet (T104), Ris - Kråkbäret (T107), Ris - Lingonet (T105), Ris - Ripbäret (T106) | Emily O'Connor, Samantha Mellinger | Chapter 7 (Population genetics) | |||||||||||||||||||||||||
| Fre 7 Feb. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | Föreläsning | Ängen (G111) | Bengt Hansson | Genes in populations II - structure | |||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 11:00 | Obligatoriskt, Seminarium | Ängen (G111) | Bengt Hansson | Population structure exercise II - allele data | |||||||||||||||||||||||||
| 11:00 - 12:00 | Laboration, Obligatoriskt | Ängen (G111) | Bengt Hansson | Population structure exercise III - mtDNA data | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | Laboration, Obligatoriskt | Ängen (G111) | Staffan Bensch | Primer design | |||||||||||||||||||||||||