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Room, Location Comment |
Teacher, External teacher |
Title, Public comment, URL |
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| w35 | Mon 2022-08-29 w35 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Compulsory, Introduction | Bioinformatik (D226) | Dag Ahrén, Eran Elhaik | Bioinformatics: meet your coordinator Group photo | ||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Dag Ahrén | Bioinformatics - an overview | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Anna Runemark, Arthur Boffelli Castro, Dag Ahrén | Computer set up and introduction | ||||||||||||||||||||||||
| Tue 2022-08-30 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Claes von Wachenfeldt | Structural bioinformatics | ||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Damandeep Kaur | Structural bioinformatics | ||||||||||||||||||||||||
| Wed 2022-08-31 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part I) | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Damandeep Kaur | Practical Sequence analysis (I) | ||||||||||||||||||||||||
| Thu 2022-09-01 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Eran Elhaik | Introduction to population genetics | ||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Eran Elhaik, Mara Vizitiu | Portfoloio, Project structure and Reproducibility | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 14:00 | BINP11 | Compulsory, Information | Navigating your way through studies in Sweden, Jep. General information, Tina och Lotta. Compulsory for all new master's students. Location: A213 Hörsal | ||||||||||||||||||||||||||
| Fri 2022-09-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Markus Ringnér | Hidden Markov models (HMM) | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mattis Knulst, Mara Vizitiu | Hidden Markov models (HMM) | ||||||||||||||||||||||||
| w36 | Mon 2022-09-05 w36 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Markus Ringnér | Artificial Neural Networks (ANN) | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mattis Knulst, Mara Vizitiu | Artificial Neural Networks (ANN) | ||||||||||||||||||||||||
| Tue 2022-09-06 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Dag Ahrén | Nucleic acid and protein sequence databases | ||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 16:00 | BINP11 | Lecture, Laboratory session | Bioinformatik (D226) | Arthur Boffelli Castro, Dag Ahrén | Nucleic acid and protein sequence databases | ||||||||||||||||||||||||
| Wed 2022-09-07 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Dag Ahrén | Biological databases | ||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Arthur Boffelli Castro, Dag Ahrén | Biological databases | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part II) | ||||||||||||||||||||||||
| Thu 2022-09-08 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part III) | ||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Claes von Wachenfeldt, Damandeep Kaur | Practical sequence analysis (III). | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 17:00 | BINP11 | Excursion | All: Excursion w bus to interesting places around Lund, bring fika and good shoes (some walking). Note: We only go if the weather is ok! | ||||||||||||||||||||||||||
| Fri 2022-09-09 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Eran Elhaik | Bacterial genome analysis | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Eran Elhaik, Mara Vizitiu | Genome analysis | ||||||||||||||||||||||||
| w37 | Mon 2022-09-12 w37 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Eran Elhaik | Population genetics | ||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Eran Elhaik, Sara Behnamian | Population genetics | ||||||||||||||||||||||||
| Tue 2022-09-13 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp | Phylogenetic analysis (I and II) | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 14:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp | Phylogenetic analysis (III) | ||||||||||||||||||||||||
| 14:00 - 16:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp | Phylogenetic analysis (III) | ||||||||||||||||||||||||
| Wed 2022-09-14 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Phylogenetic analysis using MEGA | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Project: Phylogenetics | ||||||||||||||||||||||||
| Thu 2022-09-15 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Project: Phylogenetics | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Lecture on Scientific Writing, Caroline Isaksson. Location: A213 Hörsal | ||||||||||||||||||||||||||
| Fri 2022-09-16 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Mikael Pontarp, Mara Vizitiu | Project: Phylogenetics, presentations | ||||||||||||||||||||||||
| w38 | Mon 2022-09-19 w38 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Helena Persson | Next-generation sequencing (NGS) application | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Helena Persson, Virá Varga | Next-generation sequencing (NGS) application | ||||||||||||||||||||||||
| Tue 2022-09-20 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Dimitrios Floudas | Eukaryotic genome analysis (I) | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Dimitrios Floudas | Gene annotation methods | ||||||||||||||||||||||||
| Wed 2022-09-21 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Bioinformatik (D226) | Dimitrios Floudas | Eukaryotic genome analysis (II) | ||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Laboratory session, Compulsory | Bioinformatik (D226) | Dimitrios Floudas | Gene annotation methods | ||||||||||||||||||||||||