| Time | Course | Activity, Lokalbokningsaktivitet | Staff | Title, Public comment, URL | |||||||||||||||||||||||||
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| w36 | Mon 2020-08-31 w36 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 11:00 | BINP11 | Compulsory, Introduction | Anna Runemark, Dag Ahrén, Eran Elhaik | Introduction, meet your coordinator | |||||||||||||||||||||||||
| 11:15 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Dag Ahrén | Bioinformatics - an overview | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Anna Runemark, Dag Ahrén | Computer set up and introduction | |||||||||||||||||||||||||
| Tue 2020-09-01 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Dag Ahrén | Nucleic acid and protein sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Dag Ahrén | Biological databases | |||||||||||||||||||||||||
| Wed 2020-09-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Lecture | Anna Runemark, Dag Ahrén, Eran Elhaik | Portfolio, Project structure and Reproducibility | |||||||||||||||||||||||||
| Thu 2020-09-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Structural bioinformatics | |||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Claes von Wachenfeldt | Structural bioinformatics | |||||||||||||||||||||||||
| 12:30 - 13:15 | BINP11 | Compulsory, Distance education due to COVID-19, Information | Compulsory via Zoom (https://lu-se.zoom.us/j/67837022690) Navigating your way through studies in Sweden: Jep Agrell Important information, Tina Ledje, Lotta Persmark | ||||||||||||||||||||||||||
| Fri 2020-09-04 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part I) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Claes von Wachenfeldt | Practical Sequence analysis (II) | |||||||||||||||||||||||||
| w37 | Mon 2020-09-07 w37 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Torbjörn Säll | Introduction to probability analysis | |||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Torbjörn Säll | Probability analysis | |||||||||||||||||||||||||
| Tue 2020-09-08 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Markus Ringnér | Hidden Markov models (HMM) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Markus Ringnér | Hidden Markov models (HMM) | |||||||||||||||||||||||||
| Wed 2020-09-09 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Markus Ringnér | Artificial Neural Networks (ANN) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Markus Ringnér | Artificial Neural Networks (ANN) | |||||||||||||||||||||||||
| Thu 2020-09-10 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part IIb) | |||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Claes von Wachenfeldt | Practical sequence analysis (II) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Compulsory, Information | Lecture: Scientific Writing. Compulsory for new students at the Biology dept. | ||||||||||||||||||||||||||
| 15:15 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Information | Lecture on Cheating and Plagiarism. Compulsory for new students at the Biology dept. | ||||||||||||||||||||||||||
| Fri 2020-09-11 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 08:15 - 10:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Sequence analysis (Part III) | |||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Claes von Wachenfeldt | Practical sequence analysis (III). Group assignments | |||||||||||||||||||||||||
| w38 | Mon 2020-09-14 w38 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Claes von Wachenfeldt | Bacterial genome analysis | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Claes von Wachenfeldt | Genome analysis | |||||||||||||||||||||||||
| Tue 2020-09-15 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:15 | BINP11 | Compulsory, Lecture | Helena Persson | Next-generation sequencing (NGS) application | |||||||||||||||||||||||||
| 10:30 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Helena Persson | Next-generation sequencing (NGS) application | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Extra time to complete exercises. | ||||||||||||||||||||||||||
| Wed 2020-09-16 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 15:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Extra time to complete exercises. | ||||||||||||||||||||||||||
| Thu 2020-09-17 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Lecture | Staffan Bensch | Phylogenetic analysis (I and II) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 15:00 | BINP11 | Compulsory, Information | Library information: Searching and handling sources. Compulsory for new students at the Biology dept. | ||||||||||||||||||||||||||
| Fri 2020-09-18 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 10:00 | BINP11 | Compulsory, Lecture | Staffan Bensch | Phylogenetic analysis (III) | |||||||||||||||||||||||||
| 10:15 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Seminar | Staffan Bensch | Phylogenetic analysis (III) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Hanna Sigeman | Phylogenetic analysis using MEGA | |||||||||||||||||||||||||
| w39 | Mon 2020-09-21 w39 | ||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 12:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Staffan Bensch | Project: Phylogenetics | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Staffan Bensch | Project: Phylogenetics | |||||||||||||||||||||||||
| Tue 2020-09-22 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 09:00 - 11:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Staffan Bensch | Project: Phylogenetics, presentations | |||||||||||||||||||||||||
| Wed 2020-09-23 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Mikael Pontarp | Eukaryotic genome analysis (I) | |||||||||||||||||||||||||
| 13:00 - 16:00 | BINP11 | Compulsory, Laboratory session | Mikael Pontarp | Gene annotation methods | |||||||||||||||||||||||||
| Thu 2020-09-24 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 10:00 - 12:00 | BINP11 | Lecture | Mikael Pontarp | Eukaryotic genome analysis (II) | |||||||||||||||||||||||||